2017-2018学年医学院共有研究生177人。其中参加集中教学一年级研究生147人，包括学术硕士102人，专业硕士41人，博士（直博生）4人，分别来自昆明植物研究所（39人）、广州生物医药与健康研究院（34人）、动物研究所（20人）、微生物研究所（16人）、成都生物研究所（15人）、西北高原生物研究所（7人）、兰州化学物理研究所（4人）和医学院校本部（12人）共计8个中科院培养单位，包括药物化学（30人）、细胞生物学（25人）、生物工程（22人）、发育生物学（15人）、生物化学与分子生物学（13人）、药学硕士（14人）、中药学（7人）、药理学（7人）、病原生物学（6人）、制药工程（5人）、微生物学（2人）、病理学与生理病理学（1人）共计12个学科/专业。
其中本部高年级研究生30人，包括硕士10人，博士20人，涉及生物化学与分子生物学、细胞生物学、生物工程、免疫学、病原生物学、人体解剖与组织胚胎学等7个学科/专业。
